- Первый раз монастырь пострадал от войны 1812 года. Был занят армией Наполеона и почти полностью уничтожен.
- Второй раз над ним поглумились основатели НЭПа. Колокольни были взорваны, а в монашеских кельях устроили кабинеты и увеселительные заведения.
В послевоенное время монастырь представлял собой жалкое зрелище – абсолютное запустение.
В 1995 году Святейший Патриарх Московский Алексий II, благословил восстановить на этом месте Покровский ставропигиальный женский монастырь.
Настоятельницей была назначена монахиня Феофания(Мискина).
Зарегистрировали Устав монастыря.
И 14 октября 1995 года на Покров Божией Матери/ Престольный праздник монастыря/ после праздничной Литургии, был совершен крестный ход.
В 1996 году по указу московского правительства монастырю были переданы храмы, постройки и земля в бессрочное и безвозмездное пользование.